相关文章
GaussView 5.0与Gaussian 09W使用学习记录
Gaussian 09W和GaussView 5.0学习记录 Calculation setupJob typeMethodTitleLink0最底下一栏 Guassian 09FileProcess Existing File job Edit.out文件几何优化优化计算对电子密度进行研究、绘图计算分子的HOMO/LUMO，判断反应位点预测过渡态的方法与理论QST2方法预…
为您详解在ChemDraw中进行3D建模的方法
作为强大的化学绘图软件，ChemDraw不仅可以用来画各种分子结构图，还可以将其转化为3D模型，便于观察其中的结构组成，如果你不知道怎么操作，下面就一起来学习具体操作技巧。
ChemDraw软件获取地址：http://wm.makeding.com/iclk/?zoneid=18518 打开化学公式编辑软件，在Che…
ChemDraw怎么画3D图？
ChemDraw 15版本中有专门绘制3D结构的组件——ChemBio 3D，可以用来绘制各种满足需要的立体结构，有5种不同的键可供选择。为了方便大家的使用，本节将为大家详解ChemDraw画3D图的技巧。 Chem 3D组件是ChemOffice的主要模块，用于分子…
分子对接 molecular docking
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S094471132400374X?via%3Dihub
GitHub - beikwx/SailVina: SailVina重构增强版
Molecular docking
Download the PTPRB protein structure on the PDB database (RCSB PDB: Homepage). Select the high-resolution PTP…
ChemDraw 2D与ChemBio 3D之间的信息转换
ChemBio 3D是一款专业的三维分子结构演示软件，可在2D与3D之间转换，本教程将详解如何在ChemDraw 2D与ChemBio 3D之间进行信息转换。 1.ChemDraw的信息输出 （1）启动ChemDraw，一个无标题的文件窗口出现。 （2）在ChemDraw中，选择【苯环】工具。 （3）在文件窗口单击建立一个…
【3D数学基础】笛卡尔坐标系统
计算机图形学第一准则：近似原则如果它看上去是对的它就是对的 一、 1D数学
就是小时候学过的数轴概念 研究自然数和整数的领域称为离散数学，研究实数的领域称为连续数学 现实世界中使用的术语“实数”，通常是离散的意思。 3D虚拟世界的设计也…
Chem. Sci. | 3D深度生成模型进行基于结构的从头药物设计
本文介绍来自北京大学来鲁华教授课题组发表在Chemical Science上的文章“Structure-based de novo drug design using 3D deep generative models”。在这项工作中，作者介绍了一种基于深度学习的新型药物设计方法DeepLigBuilder，可以在靶标蛋白结合位点生…
如何用ChemDraw实现3D建模
作为强大的化学软件，ChemDraw给化学工作者带来了极大地便利，其中的ChemBio 3D建立结构模型的方法多式多样，可以通过使用键工具按动建立，也可以通过在Replacement Text中输入化学符号建立，下面就通过两个实例讲解如何使用建立分子结构的3D模型。
ChemDraw软件免费试用下载…
3D开发学习之笛卡尔坐标系
作者：朱金灿 来源：clever101的专栏 为什么大多数人学不会人工智能编程？>>> 一.2D笛卡尔坐标系的定义 2D笛卡尔坐标系具有以下特点： 1.2D笛卡尔坐标系都具有一个原点，原点坐标为(0,0); 2.2D笛卡尔坐标系都有…
Chem 3D中怎么创建立体模型
ChemDraw作为一款很受大家欢迎的化学绘图软件，其在绘制平面化学方面的功能已经非常的强大了，其实它也可以绘制3D图形。Chem 3D就是绘制3D图形的重要组件。而且为了满足不同的用户绘图的需求，可以给大家提供三种方法来绘制3D图形。有的方法需要…
Chem 3D软件可以改变背景吗
化学绘图过程中常常需要绘制三维结构的图形，Chem 3D软件是ChemOffice套件中专门用于绘制三维结构的组件。用过它的用户会发现，其背景颜色通常都默认为深蓝色，但是不是每个场景都适合用深蓝色的背景。所以一些用户朋友就希望可以改变背景颜色&…
怎么绘制旋转Chem3D模型
化学领域的专业人士常常需要绘制各种化学图形，特别是3D的图形，这个就需要用到一些化学绘图软件。Chem3D是ChemOffice的核心组件之一，可以绘制化学三维模型，包括新建、删除、旋转、移动等基础编辑操作，除此之外Chem3D还…
在Chem 3D软件用什么方法可以改变背景
化学绘图过程中常常需要绘制三维结构的图形，Chem 3D软件是ChemOffice套件中专门用于绘制三维结构的组件。用过它的用户会发现，其背景颜色通常都默认为深蓝色，但是不是每个场景都适合用深蓝色的背景。所以一些用户朋友就希望可以改变背景颜色&…
Chem 3D模型的参数值更改方法
在化学绘图软件ChemOffice 15.1中有个专门用于绘制三维结构的组件，就是Chem 3D。通过这个组件用户可以绘制3D模型并可以通过这个组件来计算一些化学数据。在使用Chem 3D组件过程中，你会发现它有自己默认的一些化学结构参数，如果这些参数不是你…
rdkit 力场优化UFFOptimizeMolecule、MMFFOptimizeMolecule；chem3D 3D分子生成；获取分子坐标对象
rdkit 力场优化UFFOptimizeMolecule、MMFFOptimizeMolecule
参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/82588052 https://projects.volkamerlab.org/teachopencadd/talktorials/T010_binding_site_comparison.html
EmbedMolecule模块将二维分子图转化为三维分子坐标
原始没优化前…
修改Chem 3D模型的化学键属性的方法有哪些
很多的用户在绘制化学图形过程中发现很多的图形都是立体结构的，这个时候就需要用Chem3D，它是ChemOffice的核心组件之一，在绘制立体模型和计算化学数据方面具有不可替代的作用。虽然ChemDraw化学绘图工具非常的好用，但是很多的用户…
记录一些使用化学软件的心得（含bug和问题解决）
记录一些使用化学软件的心得（含bug和问题解决），目前准备记录chemoffice，其他随缘吧。 常用的化学软件 一、chemdraw1、chem3D导出tif格式显示问题问题的提出：问题的解决： 一、chemdraw
1、chem3D导出tif格…
cmd输入输入javac无效解决方案
jdk的环境变量问题
系统：windows10,64bit
问题描述：官网上下载的jdk,默认安装到C盘目录底下C:\Program Files\Java\jre1.8.0_201\lib，环境变量JAVA_HOME,path,classpath全部配置正确，在cmd中输入javac命令无效。 解决方法&#…